1.4. Clasificación de los virus de Baltimore

Hace 50 años Baltimore publicó el artículo sobre la clasificación de los virus según las vías de expresión genómica. La componen seis clases de virus (a las que se ha añadido posteriormente una séptima) que se distinguen por sus diferentes rutas de transferencia de información desde el ácido nucleico que compone genoma del virus. Han significado el marco conceptual sobre el que se ha desarrollado la virología durante las últimas cinco décadas. Las cinco clases de virus ARN y de transcripción inversa comparten un origen con el inicio de la vida, mientras que tanto los virus de ADN monocatenario como los de ADN bicatenario evolucionaron independientemente en múltiples ocasiones. La mayoría surgieron durante la era más temprana de la evolución, antes del advenimiento de las células con grandes genomas de ADN bicatenario (Koonin EV, 2021).

Esta simple clasificación cubre las vías de transmisión de información desde el ácido nucleico encapsulado (encapsidado) en el virión hasta el ARNm, a partir del cual se traducen las proteínas del virus. Incorpora el descubrimiento de la transcriptasa inversa (RT, reverse transcriptase) del retrovirus. En el dogma central de la biología molecular, la transferencia de la información va del ADN al ARN y a la proteína. La transcriptasa inversa permite, en situaciones especiales, la transferencia inversa del ARN al ADN, la replicación del ARN sin la participación del ADN e incluso la traducción directa del ADN.

Clasificación de Baltimore (modificada de Koonin EV y cols. 2021)

dc: doble cadena; cs: cadena simple; RT: transcriptasa innversa

Las clases II a la VII tienen genomas diminutos comparados con la clase I. Los virus ADNdc pueden elegir entre la maquinaria de replicación celular anfitriona o codificar con la propia. Las células suelen evitar la replicación del ARN y la transcripción inversa del ARN en ADN. Todos los virus de clase III a VII invariablemente han de codificar una ARN polimerasa dependiente de ARN (RdRP) o RT, que las incorporan junto con el resto de la maquinaria enzimática necesaria para la expresión del ARNm en los viriones. Los virus clase IV no llevan la maquinaria enzimática en el virión porque el genoma del ARN se traduce directamente tras la infección. Los virus DNAcs dependen de la maquinaria enzimática del anfitrión para la replicación y transcripción del genoma. Los pequeños virus DNAsc de la clase II codifican una única enzima replicativa, la endonucleasa implicada en el inicio de la replicación del ADN. Los virus ADNcd de clase I también dependen de los sistemas de replicación y transcripción del anfitrión para codificar una amplia gama de proteínas involucradas en estos procesos (Koonin EV, 2021).